研究所建所以来，在肿瘤学基础理论研究、常见主要肿瘤的临床诊断与、胃癌、食管癌高发区现场的预防干预研究等领域均有创新与的成绩，在国内外颇具影响。
北京大学肿瘤医院与许多国际知名肿瘤研究机构建立了密切的合作关系，每年不断有国内外专家学者来院参观、考察、讲学，进行科研协作与学术交流。医院也不断有科研、临床、医技专业人员出国访问、进修、短期工作或参加国际学术会议。
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