清掏周期为3～12个月，实际设计中多取3～9个月，而酸性发酵阶段的酸性发酵期为3个月，酸性减退期为5个月左右。实践证明：清掏周期的取定，应兼顾污水处理效果、建设造价、管理三个方面因素清掏周期一般不宜少于12 个月。
化粪池的清掏周期与粪便污水温度、气温、建筑物性质及排水水质、水量有关。设计清掏周 期过短，则化粪池粪液浓度过高，与实际清掏周期差距过大，影响正常发酵和污水处理效果，甚至造成粪液漫溢，影响环境卫生。设计清掏周期过长，则化粪池容积过大，增加造价。
清理化粪池就是给化粪池定期清理。化粪池（huàfènchí）是处理粪便并加以过滤沉淀的设备。其原理是固化物在池底分解，上层的水化物体，进入管道流走，防止了管道堵塞，给固化物体（粪便等垃圾）有充足的时间水解。 化粪池（septic tank）指的是将生活污水分格沉淀，及对污泥进行厌氧消化的小型处理构筑物。
化学清理是一种相对较新的清理方式，它使用化学物质对化粪池进行清洗，同时能够消除异味、除垢效果好。化学清洗是通过环保清理产品，如油垢清洁剂、活性污泥等进行清理，以达到清洁、除臭等目的。这种方法清理效果好，速度快，但是会影响环境健康，需要注意防护措施，防止化学物质对人体造成损害。