如果保函中未曾写明预付款保函的担保金额，将随保函归还金额而相应减少，则很可能出现预付款已大部分偿还，而保函额不减的局面，业主随时可能全额没收保函，而承包商却不拥有全额预付款（因为很可能在业主没收保函时，承包商已经偿还了部分预付款）。
工程招投标后为了使交易时更加放心有保障，都会要求对方开具一份预付款保函，这样既可避免交易中爽约的损失，在任何银行开具预付款保函的企业，首先是银行的开户会员，然后都必须是合法的企业有相关的营业执照等合法文件、有足够的业务资质等等，然后就可以在银行申请预付款保函，审核通过后就可以开出了。
一般情况保函的金额就是预付款的金额。但对预付款的付款时间和合同交货时间较长而且金额较大的合同，我们在商务谈判中可要求保函的金额为预付款金额加上从预付款支付到买方索偿这段时间的利息，利率买卖双方事先商定。除保函另有声明外，保函担保金额不因合同被部分履行而减少。
买方无时间办理索偿手续。对失效地点在卖方所在地的保函，当买方获知卖方未能在迟装船期内履行交货义务，此时保函时效也已到，由于地理位置的差异，买方已没有时间办理有关索偿手续。所以我们应要求保函有效期至合同迟装船期后几个工作日较妥。我们之所以强调是“工作日”主要考虑遇到节假日的情况。